„Prieš ketverius metus tyrėjų komanda, vadovaujama mikrobiologijos srities sunkiasvorio, išsakė stulbinantį teiginį: vėžys turi unikalių mikrobų parašų, kurie vieną dieną gali leisti navikus diagnozuoti, atliekant kraujo tyrimą.
Šis atradimas patraukė mokslo bendruomenės ir investuotojų dėmesį.
Prestižinis žurnalas paskelbė tyrimą. Tyrimas cituojamas daugiau, nei 600, straipsnių. Bent keliolika grupių jo duomenimis grindė naujus darbus. Mikrobiologai, atsakingi už teiginį, įkūrė startuolį, kad pasinaudotų jų išvadomis.
Nuo tada darbas patyrė daugybę nesėkmių.
Straipsnis buvo atšauktas birželio mėn., kai jį sukritikavo kiti mokslininkai, kurie suabejojo metodika ir teigė, kad išvados, greičiausiai, yra neteisingos. Parama startuoliui išseko. Ir paskelbtus tyrimus, kurie rėmėsi šio tyrimo duomenimis, gali tekti taisyti arba atšaukti.
Įvykiai iliustruoja, toli siekiantį, ydingo mokslo efektą.
„Tai užteršė literatūrą“, – sakė Johnso Hopkinso universiteto skaičiavimo biologas Stevenas Salzbergas, kurio kritika, parašyta kartu su kitais šios srities kolegomis, paskatino tyrimą atšaukti.
Kai 2020 m. tyrimas buvo paskelbtas žurnale Nature, aukšto rango vyresniojo mokslo darbuotojo reputacija prisidėjo prie dėmesio šiam darbui.
Robas Knightas, Kalifornijos universiteto San Diege profesorius, vadovavęs tyrimui, plačiai laikomas didelių duomenų mikrobų analizės pradininku. Jo gyvenimo aprašyme išvardyti keli apdovanojimai ir prestižinės stipendijos mokslo draugijose, dvi knygos ir TED pokalbis. Daugiau, nei prieš dešimtmetį, kai federalinė vyriausybė ėmėsi didžiulių pastangų dokumentuoti mikrobų vaidmenį žmonių sveikatai, Knight sukūrė pagrindinio dalyvio ir prisidėjusiojo reputaciją.
Universiteto atstovo spaudai pranešime Knightas teigė, kad straipsnio iš Nature atsiėmimas buvo pagrįstas, tačiau pagrindinės straipsnio išvados yra teisingos.
Nature paskelbtame tyrime jis ir jo bendraautoriai pranešė, kad 32 skirtingos vėžio formos, nuo prostatos navikų iki odos melanomų, turi unikalių mikrobų, daugiausia bakterijų ir virusų, derinių, kurie veikė, kaip kiekvieno naviko tipo pirštų atspaudai. Idėja turėjo klinikinę reikšmę: kraujo tyrimas leistų gydytojams panaudoti kraujyje aptiktų mikrobų įrodymus, kaip pagrindą vėžiui diagnozuoti.
Remiantis duomenimis iš daugiau, nei 17 000, mėginių iš daugiau, nei 10 000, vėžiu sergančių žmonių, šis dokumentas buvo įvertintas kaip „tour de force“, siekiant atlikti sudėtingas analizes apie didžiulį duomenų srautą.
„Tai buvo labai ambicingas tyrimas ir daugybė duomenų“, – sakė Teksaso universiteto MD Andersono vėžio centro Hiustone vėžio mikrobiologė Susan Bullman, kuri tiria į kolorektalinius navikus įsiskverbiančias bakterijas ir tyrime nedalyvavo. „Jei būtų grupė, kuri galėtų tai padaryti, tai būtų Robo Knighto grupė."
Per pastarąjį dešimtmetį mokslininkai, įskaitant Bullman, surinko įrodymų, kad žarnyno navikuose, kuriuose gausu mikrobų, nuolat buvo bakterijų. Knight tyrimas buvo pirmasis, kuris ištyrė vėžį visame žmogaus kūne ir parodė, kad mikrobai egzistavo deriniais, kurie buvo unikalūs kiekvienam naviko tipui.
„Tai tikrai buvo pirmasis toks stulbinantis atradimas“, – sakė Harvardo T.H. skaičiavimo biologas Curtisas Huttenhoweris iš Chano visuomenės sveikatos mokyklos, kuri tiria žmonėse gyvenančias bakterijas. Huttenhoweris bendradarbiavo su Knight kituose darbuose, bet nedalyvavo šiame tyrime.
Prieš metus iki publikacijos Knight ir dar du tyrimo autoriai įkūrė kompaniją Micronoma, kurios tikslas buvo atlikti kraujo tyrimus, kad būtų galima nustatyti mikrobų genetinę medžiagą ir anksti sugauti vėžį.
„Micronoma“ surinko mažiausiai 17,5 mln.dolerių iš „SymBiosis“, investicinės įmonės, įsikūrusios Bentonvilyje, Ark., ir „Seerave Foundation“, filantropijos organizacijos.
Bendrovė paskelbė apie bendradarbiavimą su Naujojo Pietų Velso universiteto komanda 2021 m., siekdama medžioti mikrobinius kepenų vėžio žymenis, dalį vyriausybės dotacijos už 4 milijonus Australijos dolerių (atitinka apie 3 milijonus JAV dolerių) ir partnerystę su grupe NYU Langone Health pažvelgtų į plaučių vėžį, kuri yra Nacionalinio sveikatos instituto dotacijos dalis, skirianti daugiau, nei 703 000 dolerių 2023 m.
Tuo tarpu FDA suteikė „Proveržio“ pavadinimą „Micronoma“ prietaisui tirti kraują dėl plaučių vėžio, todėl prietaisas buvo paspartintas patvirtinimui.
Tačiau nepriklausomi tyrinėtojai pradėjo kelti pavojaus signalą.
Kai kurių mikrobų, kuriuos mokslininkai pažymėjo, kaip vėžio požymių komponentus, žmonėse nebuvo žinoma, todėl buvo atliktas tolesnis tyrimas. Skaičiavimo biologas Salzbergas ir komanda išanalizavo keletą vėžio tipų ir nerado daugumos bakterijų, nurodytų Nature tyrime. Jų analizė, paskelbta 2023 m. spalį žurnale mBio, teigia, kad „beveik tobulas ryšys tarp mikrobų ir vėžio tipų, apie kurį pranešta tyrime, yra paprasčiausiai fikcija“.
Tarp klaidų, remiantis kritika, UC San Diego komanda neteisingai panaudojo genominį įrankį, kurį sukūrė Salzbergo laboratorija, kad auglio duomenys būtų suderinti su mikrobų sekomis.
„Tai nebuvo artimas skambutis“, – „The Wall Street Journal“ sakė Salzbergas. "Šie duomenys yra visiškai neteisingi."
Elektroniniu paštu atsiųstame atsakyme Knightas teigė, kad Salzbergo kritika įtaria, bet neįrodo klaidų, ir nurodė straipsnį, kurį jis ir jo bendraautoriai paskelbė žurnale Oncogene vasario mėn., kuriame pripažinta kritika ir pateikta nauja analizė, kuri, jų teigimu, patvirtina jų pagrindinį teiginį.
Kai „Nature“ birželio mėn. atsiėmė pradinį tyrimą, ji citavo Salzbergo kritiką ir pažymėjo, kad visi straipsnio autoriai sutiko su jo atsiėmimu.
Kai padaugėjo kritikos dėl straipsnio, Micronoma partnerystės nutrūko.
Pasak NYU atstovo, NYU Langone praėjusiais metais nutraukė savo asociaciją su Micronoma. Pasak pagrindinio mokslininko, Naujojo Pietų Velso universiteto bendradarbiavimas nebėra aktyvus. „Seerave“ generalinis direktorius Manuelis Fankhauseris atsisakė pateikti išsamios informacijos apie savo dalyvavimą „Micronoma“. „SymBiosis“ neatsakė į prašymus komentuoti. Tačiau, pasak buvusio Micronomos vyriausiojo operacijų pareigūno Darrylo Garrisono, finansavimas išseko.
Knight ir UC San Diego klausimus apie Micronoma perdavė Eddie Adams, buvusiam bendrovės generaliniam direktoriui ir prezidentui. Adamsas neatsakė į kelis prašymus pakomentuoti.
Tuo tarpu tyrimų grupės, kurios, pasak Salzbergo, rėmėsi tyrimo duomenimis, sprendžia, su situacijos rezultatais susijusias, problemas, kaip ir žurnalai, kurie paskelbė darbą.
Pasak leidėjų Springer Nature, Frontiers, Wiley ir Amerikos vėžio tyrimų asociacijos atstovų, aštuonių tyrimų leidėjai arba žurnalų redaktoriai pradėjo peržiūrėti dokumentus. Atitinkami šių tyrimų autoriai neatsakė į prašymus pakomentuoti." [1]
1. Debunked Cancer Study Has Wide Ripple Effects. Subbaraman, Nidhi. Wall Street Journal, Eastern edition; New York, N.Y.. 31 Aug 2024: A.1.
Komentarų nėra:
Rašyti komentarą