Sekėjai

Ieškoti šiame dienoraštyje

2023 m. vasario 19 d., sekmadienis

Startuoliai imasi DNA lyderio „Illumina“ --- Įmonės nori sumažinti sekos nustatymo išlaidas ir išplėsti technologijų pritaikymą

  „Startuoliai meta iššūkį rinkos lyderei Illumina Inc., siekdamos sumažinti DNR sekos nustatymo kainą ir išplėsti technologijos naudojimą, atliekant tyrimus ir mediciną.

 

     DNR sekos nustatymas leidžia mokslininkams perskaityti atskiras genetinio kodo bazes arba raides. Tai skatina biologinius tyrimus ir naujų vaistų bei diagnostikos priemonių medžioklę.

 

     „Illumina“, kurios rinkos kapitalizacija viršija 33 milijardus dolerių, dominuoja sektoriuje, išleisdama instrumentus, kurie sumažino viso genetinės medžiagos rinkinio ląstelėse, genomo, sekos nustatymo išlaidas iki 600 dolerių. Prieš 20 metų ši kaina siekė apie 100 milijonų dolerių. Du startuoliai siekia dar labiau sumažinti išlaidas. „Element Biosciences Inc.“, remiama daugiau nei 400 mln. dolerių rizikos kapitalo, teigia, kad jos instrumentai gali sekti genomą už 200 dolerių; „Ultima Genomics Inc.“ užsitikrino daugiau nei 600 mln. dolerių, kad sukurtų technologiją, kuri sumažintų išlaidas iki 100 dolerių.

 

     Konkuruoti su „Illumina“, kuri diegia savo naują, nebrangią, sekos nustatymo technologiją, bus sudėtinga startuoliams, kurie pradėjo pardavinėti sistemas mokslininkams.

 

     Mažoms įmonėms būtų reikšminga užimti net nedidelę šio sektoriaus dalį, sakė investicinio banko „Canaccord Genuity“ analitikas Kyle'as Miksonas. Jis prognozuoja, kad pasaulinė sekos rinka iki 2030 m. padidės daugiau nei dvigubai iki 110 mlrd. dolerių.

 

     „Jei pažiūrėtumėte per 10 metų, manome, kad beveik kiekvienam žmogui bus atliktas tam tikras genetinės sekos nustatymo tyrimas, tikriausiai bent kartą per metus“, – sakė Yairas Schindelis, „aMoon Fund“ įkūrėjas ir vadovaujantis partneris. Didžiausias investuotojas.

 

     Žmogaus genomo projektas, tarptautinės pastangos nustatyti žmogaus genomo seką pirmą kartą, vyko 1990–2003 m. Mokslininkai naudojo Sangerio sekos nustatymą, kurį aštuntajame dešimtmetyje sukūrė Nobelio premijos laureatas Frederickas Sangeris, kuris naudoja fluorescencinius dažus atskiroms genetinėms raidėms identifikuoti.

 

     Naujos kartos sistemos, įskaitant „Illumina“, padidino DNR sekos nustatymo efektyvumą. Užuot skaitę vieną fragmentą vienu metu, kaip Sangerio sekvenavime, naujos kartos sekos nustatymas leidžia masiškai sekti DNR fragmentus. „Illumina“ metodas apima milijardų DNR grupių sukūrimą ant substrato, vadinamo srauto ląstele.

 

     „Illumina“ 2010 m. išleido mašiną, leidžiančią nustatyti genomo seką už maždaug 10 000 dolerių, sakė vyriausiasis technologijų pareigūnas Alexas Aravanis. Vėlesnės naujovės sumažino kainą iki 1000 dolerių 2014 m., o iki 600 dolerių 2020 m. „Illumina“ išleidžia naują instrumentų seriją „NovaSeq X“, kuri sumažina iki 200 dolerių, pridūrė jis.

 

     Pasak Illumina, ši nauja sistema įgalino keletą pažangų, įskaitant chemijos, aparatinės įrangos ir optikos patobulinimus.

 

     DNR sekos nustatymo išlaidoms mažėjant, rizikos kapitalistai stengėsi pasinaudoti pramonės augimu. DNR sekos naudojimas atliekant prenatalinius ir vėžio tyrimus pastaraisiais metais smarkiai išaugo, nes sumažėjo išlaidos, o 200 dolerių vertės genomas paskatins šią technologiją naudoti įprastoje sveikatos priežiūroje, sakė Jimas Tananbaumas, „Element Biosciences“ investuotojo „Foresite Capital“ vadovas.

 

     „Mes visi esame unikalūs, nes turime unikalų genetinį kodą“, – sakė daktaras Tananbaumas. „To kodo skaitymas leidžia individualizuoti priežiūrą, kad ji būtų teikiama dideliu mastu.

 

     „Element“, įkurta 2017 m., ir „Ultima“, išleista 2016 m. pabaigoje, iki šiol veikė tyliai, nes kūrė sistemas, kurios, jų teigimu, pergalvojo sekos nustatymą.

 

     San Diege įsikūręs „Element“ teigia, kad jo sistema sumažina foninį apšvietimą ir leidžia lengviau, bei pigiau nustatyti atskiras bazes. Skirtumas panašus į žvaigždžių stebėjimą naktį be foninio apšvietimo, palyginti su bandymu pamatyti jas dieną, sakė vienas iš įkūrėjų ir vyriausiasis technologijų pareigūnas Michaelas Previte'as.

 

     Elementų srauto ląstelės turi nesurišantį paviršių, todėl prie jų prilimpa mažiau dažų, o tai sumažina foninį apšvietimą, sakė vienas iš įkūrėjų ir vadovė Molly He.

 

     „Ultima“ generalinis direktorius Giladas Almogy įkūrė įmonę Niuarke, Kalifornijoje, siekdamas pritaikyti žinias, įgytas per karjerą puslaidininkių pramonėje, siekdamas sumažinti DNR sekos nustatymo išlaidas.

 

     Vietoj įprasto srauto elemento, Ultima teigia, kad sukūrė 200 milimetrų silicio diską, leidžiantį tankiai supakuoti DNR per plokštelę. „Ultima“ teigimu, šalia plokštelės centro esantys purkštukai plonu, vienodu sluoksniu per visą paviršių paskirsto chemines medžiagas, reikalingas sekvenavimui.

 

     Silicio plokštelė yra nebrangi, o sistema leidžia labai efektyviai naudoti reagentus, o tai taip pat sumažina išlaidas, sakė dr. Almogy ir pridūrė, kad „Ultima“ turi apie tuziną pradinių klientų ir planuoja, kad visa prekyba bus pristatyta vėliau šiais metais.

 

     „Mes esame ankstyvoje genomikos duomenų augimo dešimtmečių pradžioje“, – sakė daktaras Almogy." [1]


1. Startups Take On DNA Leader Illumina --- Companies look to cut sequencing costs and widen technology's applications
Gormley, Brian.  Wall Street Journal, Eastern edition; New York, N.Y. [New York, N.Y]. 17 Feb 2023: B.6.

Komentarų nėra: