"Iki tol, kol atsirado SARS-CoV-2, labiausiai destruktyvus patogenas planetoje buvo Mycobacterium tuberculosis-bakterija, sukelianti tuberkuliozę. Remiantis naujausia Pasaulio sveikatos organizacijos ataskaita, paskelbta spalio 14 d., šis organizmas sunaikino 1,5 m gyvybių-šis skaičius yra 100 000 didesnis, nei ankstesniais metais (ir pirmas metinis padidėjimas nuo 2005 m.), daugiausia dėl to, kad dėl „Covid-19“ buvo sutrikdyta sveikatos priežiūra. Žmonėms, kurių imuninė sistema nukentėjo nuo ŽIV, kyla ypatinga rizika. 200 000 iš 680 000 mirčių nuo AIDS kasmet yra nuo antrinės tuberkuliozės infekcijos.
Tuberkuliozei gydyti naudojama daugiau, nei keliolika antibiotikų ir kitų vaistų. Tačiau atsirado M. tuberculosis padermių, kurios nėra jautrios vienam ar keliems iš jų, ir plinta nerimą keliančiu greičiu. Pavyzdžiui, beveik 500 000 iš 10 milijonų tuberkuliozės atvejų 2019 m. buvo atsparūs vaistams. Tačiau gera žinia pasirodė spalio 19 d., kai Tarptautinis tuberkuliozės konsorciumo visapusiškas atsparumo prognozavimas (CRyPTIC, trumpai) - tarptautinis bendradarbiavimas, kuris ieškojo greitų būdų, kaip diagnozuoti atsparias padermes, paskelbė savo darbo vaisius. Konsorciumo atliktos daugiau, nei 15 000 mėginių iš 27 šalių pacientų analizės rezultatas yra būdas aptikti bet kokią atsparumą sukeliančią mutaciją tam tikros bakterijos genome.
Šiuo metu sunku nustatyti, ar padermė, sukelianti tam tikrą tuberkuliozės atvejį, atspari konkrečiam vaistui. Vienas įprastas metodas, kuriam dabar yra daugiau nei 100 metų, apima mikrobų auginimą iš skreplių mėginio Petri lėkštelėje, kol jų bus pakankamai, kad susidarytų matoma plokštelė. Tada ant šios plokštelės galima apibarstyti vaistą ar vaistus, kad pamatytumėte, ar mikrobai nustoja daugintis. Tačiau M. tuberculosis dauginasi labai lėtai laboratorinėmis sąlygomis. Tai užtrunka nuo dviejų iki šešių savaičių, kol jo užtenka bandymui, ir dar iki trijų savaičių, kol tas testas duos rezultatą. Net ir tada rezultatą gali būti nelengva interpretuoti. Atsakymas į klausimą, ar vaistai pasiteisino, yra tiesiog žiūrovo akyse-ir skirtingos akių poros dažnai mato skirtingus atsakymus.
Tačiau maždaug prieš 15 metų tyrėjai, naudojantys naują genų sekos nustatymo technologiją, pradėjo nustatyti specifines, atsparumą sukeliančias mutacijas M. tuberculosis genome. Tai paskatino naudoti testą, vadinamą polimerazės grandinine reakcija (PGR), kad būtų galima ieškoti šių mutacijų mėginių. PGR tyrimui reikalingas tik nedidelis bakterijos kiekis, todėl jį galima užbaigti per kelias valandas.
Todėl PGR tyrimai dabar plačiai naudojami, siekiant nustatyti atsparumą sukeliančias mutacijas rifampicinui, vienam iš efektyviausių vaistų nuo tuberkuliozės.
CRyPTIC tyrėjai pasiūlė išplėsti PGR tyrimų apimtį, nustatydami visus galimus mutacijų derinius, kurie suteikia atsparumą bet kokiam vaistų deriniui, taip pat įvertindami su mutacijomis susijusį atsparumo lygį skirtingoms vaisto dozėms. Dalyvaujančios laboratorijos vietoj Petri lėkštelių bakterijoms auginti naudojo kultūros lėkštes su 96 šulinėliais. Šuliniuose buvo įvairaus kiekio 13 vaistų nuo tuberkuliozės. Kai vaistai turėjo laiko veikti, plokštelės buvo nufotografuotos. Tada vaizdai buvo įtraukti į duomenų bazę, kad būtų galima ištirti.
Tačiau šiai proceso daliai vis tiek reikėjo žmogaus akių. Jas tiekė 9000 žmonių iš piliečių „mokslininkų“, kiekvieną plokštelę savarankiškai nagrinėjo apie 15 tokių savanorių. Palyginę šių tyrimų rezultatus su kiekvieno mėginio viso genomo sekomis, CRyPTIC tyrėjai gali sužinoti, kokie genų pokyčių deriniai buvo koreliuojami su atsparumo vaistams formomis.
Iššifravimas
Kai kurios jų išvados stebina. Pavyzdžiui, paaiškėja, kad atsparumą sukelianti mutacija gali egzistuoti kartu su kita, kuri panaikina tą poveikį. Tačiau jie įsitikinę, kad nustatė beveik visus svarbius mutacijų derinius. Tikimasi, kad gautas katalogas bus naudojamas geresniems PGR tyrimams kurti. Ir kadangi vis greitesnis viso genomo sekos nustatymas tampa vis labiau prieinamas, jis taip pat nustatys vaistų derinį, kuris greičiausiai išgydys tam tikrą pacientą.
Tai leis individualiai gydyti tuberkuliozę. Taip pat gydymas bus mažiau varginantis. Dabartinis standartas yra kelių antibiotikų kokteilis, kurį reikia vartoti mažiausiai šešis mėnesius-režimas, turintis žiaurų šalutinį poveikį. Pacientams sunku remtis klaidingu receptu, o vėliau išbandyti kitą vaistų derinį. Daugelis nutraukia gydymą.
Be to, CRyPTIC metodas galėtų būti šablonas tiriant kitų ligų sukėlėjų atsparumą vaistams. Tai galėtų padėti sustabdyti tokio pasipriešinimo plitimą, kuris lydėjo aplaidų ir nerūpestingą antibiotikų vartojimą visame pasaulyje. Jei tiksli diagnozė gali sustabdyti šį plitimą, CRyPTIC rezultatai turės pasekmių visuomenės ir asmens sveikatos priežiūrai“. [1]
· · · 1. "Making resistance useless; Tuberculosis." The Economist, 23 Oct. 2021, p. 73(US).
Komentarų nėra:
Rašyti komentarą