„Susidurdama su nauja seka, pirmiausia ji ieško susijusių sekų duomenų bazėse, kurios gali identifikuoti aminorūgštis, kurios buvo linkusios evoliucionuoti kartu, tikintintis, kad jos yra arti 3D erdvėje.
Struktūra panašūs baltymai suteikia dar vieną būdą įvertinti atstumus tarp aminorūgščių poros naujoje sekoje.
AlphaFold kartoja palyginimus iš šių lygiagrečių būdų pirmyn ir atgal, kai bando modeliuoti 3D erdvėje aminorūgščių padėtis, nuolat atnaujindama rezultatą.“ [1]
Iš šio aprašymo matyti, kodėl ši programinė įranga negali atspėti, bent kolkas negali, kaip pasikeis baltymo struktūra, atsiradus vėžį sukeliančiai mutacijai - nes nėra reikalingų tokiai analizei duomenų.
1. WHAT’S NEXT FOR
THE AI PROTEINFOLDING
REVOLUTION
AlphaFold, software that can predict the 3D
shape of proteins, is already changing biology.
By Ewen Callaway, Nature | Vol 604 | 14 April 2022
Komentarų nėra:
Rašyti komentarą